鹿科与牛科动物IGF-1基因序列比较及分子进化分析

• 作者: 宋兴超 巴恒星 徐超 杨福合 王桂武 王雷
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鹿科 牛科 胰岛素样生长因子-1基因 序列比较 密码子
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 14-18
• 页数: 5页
• 分类号: S811.6
• 字数: 3035字
• 语种: 中文

摘要

以GenBank中已登录的梅花鹿(Cervus nippon)、马鹿(Cervus elaphus)、普通牛(Bos taurus)、水牛(Bubalus bubalis)、山羊(Capra hircus)和绵羊(Ovis aries)胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因mRNA序列为研究材料,通过DNAStar 7.0等生物信息学软件对6个物种的IGF-1基因进行序列比较及分子进化分析.结果表明:鹿科与牛科动物IGF-1基因编码区均为465 bp,并且碱基组成表现为G＞C＞A＞T,且G+C含量高于A+T；6个物种IGF-1基因密码子第1位富含A,密码子第2位4种碱基的分布相对均匀,密码子的第3位碱基C含量较高；编码区碱基序列中共检测到20个变异位点,包括10个单一变异和10个简约变异,鹿科和牛科动物IGF-1基因核苷酸和氨基酸序列的相似性均较高；(4) NJ和UPGMA两种方法构建的分子进化树均把6个物种聚为2个大类:鹿科和牛科,其中牛科又分支出牛亚科和羊亚科两类.