齿缘摄龟线粒体基因组全序列与系统进化

• 作者: 严雪瑜 唐一波 沈夏霜 蒋钦杨 郭亚芬 钟瑞鹏 黄艳华 黄钧
• 来源期刊: 动物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 齿缘摄龟 线粒体全基因组 系统进化关系
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 536-545
• 分类号: Q951
• 语种: 中文
• DOI: 10.13859/j.cjz.201404010

摘要

采用常规PCR扩增并测序获得了齿缘摄龟(Cyclemys dentata)线粒体DNA(mtDNA)全序列,并研究了其基因组结构特点;根据20种龟的线粒体基因组重链蛋白编码基因序列,分别利用最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯法(Bayesian)构建系统进化树,探讨这些龟鳖物种之间的系统进化关系.结果显示,齿缘摄龟线粒体基因组全序列长为16 489 bp(GenBank登录号为JX455823),A+T含量为61.51％,编码37个基因,包括13个蛋白质编码基因,2个rRNA,22个tRNA和1个控制区(D-loop),基因组成与其他龟鳖类动物相似;非编码区D-loop长973 bp,包含1个中央保守区(CD),2个扩展终止结合序列区(ETASs),3个保守盒(CSBs);构建的MP树、ML树和Bayesian树的拓扑结构相似,闭壳龟属7种龟聚为一枝,拟水龟属6种龟聚为一枝,齿缘摄龟与黑桥摄龟聚在一枝,3种进化树均支持这些龟鳖物种现有的分类学地位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒋钦杨	广西大学动物科学技术学院	97	256	8.0	12.0
2	黄钧	广西大学动物科学技术学院	59	739	15.0	26.0
3	郭亚芬	广西大学动物科学技术学院	113	570	9.0	20.0
4	严雪瑜	广西大学动物科学技术学院	17	31	4.0	5.0
5	黄艳华	广西大学动物科学技术学院	10	150	6.0	10.0
6	唐一波	广西大学动物科学技术学院	4	2	1.0	1.0
7	沈夏霜	广西大学动物科学技术学院	4	5	1.0	2.0