皖南黑猪H-FABP基因5'-上游区和第二内含子的多态性分析及克隆测序

• 作者: 张似青 张陈华 杜波 殷宗俊 滑志民 郑江平
• 来源期刊: 天津农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 皖南黑猪 H-FABP基因 IMF含量 PCR-RFLP 克隆测序
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医与水产养殖
• 页码范围: 26-32
• 页数: 7页
• 分类号: S828
• 字数: 5443字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-6500.2014.01.007

摘要

对皖南黑猪心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因5’-上游区和第二内含子的多态性进行分析及克隆测序,为开展皖南黑猪肉质性状分子育种奠定理论基础.采用PCR-RFLP(HinfⅠ、HaeⅢ、Msp Ⅰ 3种限制性内切酶)分子标记技术,分析了184头皖南黑猪H-FABP基因5’-上游区和第二内含子区的遗传变异情况,并对该基因的多态片段进行克隆和测序分析.结果显示:(1)在5’-上游区,HinfⅠ位点上存在多态性,等位基因H的基因频率为0.62,表现为中度多态(PIC=0.359 6);在第二内含子区,HaeⅢ位点上存在多态性,等位基因D的基因频率为0.92,表现为低度多态(PIC=0.130 7);而Msp Ⅰ位点上尚未检测到多态,基因型均为AA型;HinfⅠ *位点上也存在多态性,等位基因B的基因频率为0.78,表现为中度多态(PIC=0.282 4);(2)x2检验表明,除5’-上游区HinfⅠ多态位点外,其他3个位点均达到Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05);(3)对H-FA BP基因3个多态片段进行克隆测序分析发现,HinfⅠ-RFLP是由于1 324 bp处存在T→C的突变引起,HaeⅢ-RFLP是由于1811bp处存在C→G的突变引起,HinfⅠ *-RFLP是由于1 970 bp处存在C→T的突变引起.本试验确证了皖南黑猪H-FA BP基因5’-上游区的多态位点并在第二内含子区检测到了HaeⅢ和Hinf*Ⅰ多态位点,这可为进一步分析H-FABP基因不同基因型与IMF含量的关系,以及确定影响IMF沉积的主效基因提供一定的数据基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑江平		22	32	3.0	5.0
2	殷宗俊	安徽农业大学动物科技学院	107	617	14.0	18.0
3	张似青		25	86	5.0	8.0
4	杜波		12	20	3.0	4.0
5	滑志民		16	20	3.0	3.0
6	张陈华		9	11	2.0	3.0