茶树CsDREB-A1转录因子基因的克隆及其特性分析

• 作者: 刘志薇 吴致君 庄静 李彤 黎星辉
• 来源期刊: 植物资源与环境学报
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 CsDREB-A1基因 转录因子 抗寒性
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 页码范围: 8-16
• 页数: 9页
• 分类号: Q751|S571.1
• 字数: 4939字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7895.2014.04.02

摘要

基于茶树品种‘迎霜’( Camellia sinensis ‘Yingshuang’)的转录组数据,采用PCR方法从其基因组DNA中克隆获得编码DREB转录因子的CsDREB-A1基因。结果显示：该基因的开放阅读框( ORF)长度为585 bp,编码194个氨基酸,该氨基酸序列即为CsDREB-A1转录因子。 CsDREB-A1转录因子的N端含有AP2/ERF家族转录因子典型的AP2 DNA保守结合结构域,其中包含保守的YRG元件和WLG基序,且其第14位和第19位分别为缬氨酸和谷氨酸,该结构域的上、下游分别有PKK/RPAGRxKFxETRHP和DSAW特征序列。通过进化分析可知CsDREB-A1转录因子属于 AP2/ERF 家族中 DREB 亚族的 A1组,其与茶树 CBF 转录因子的相似性较高,与拟南芥[ Arabidopsis thaliana ( Linn.) Heynh.]等植物的DREB类转录因子也有较高的相似性。 CsDREB-A1转录因子为亲水性蛋白,理论相对分子质量为21165.4,理论等电点为pI 9.56,碱性、酸性、芳香族和脂肪族氨基酸比例分别为18%、10%、6%和18%；该转录因子只有1个包含53个氨基酸的无序化区域,且大部分无序化氨基酸位于AP2 DNA保守结合结构域内,无序化氨基酸的比例为27.32%；在CsDREB-A1转录因子的三级结构中,N端有1个ɑ螺旋、C端有3个β折叠。研究结果显示：CsDREB-A1转录因子可能与茶树的抗寒性相关。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黎星辉	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	122	1126	18.0	25.0
2	吴致君	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	10	45	4.0	6.0
3	庄静	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	21	72	5.0	8.0
4	刘志薇	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	9	36	3.0	6.0
5	李彤	南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所	4	13	2.0	3.0