茶树cpDNA测序及基于cpDNA序列的山茶属植物亲缘关系研究

• 作者: 刘声传 陈亮 陈春梅 马建强 马春雷
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 叶绿体基因组 高通量测序 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 页码范围: 371-380
• 页数: 10页
• 分类号: S571.1|S326
• 字数: 4806字
• 语种: 中文

摘要

叶绿体基因组在物种鉴定、系统进化分析及亲缘关系研究等领域应用前景广阔。本文应用 Illumina 高通量测序技术对龙井43（Camellia sinensis cv. Longjing 43）的叶绿体全基因组进行测序；利用叶绿体trnL-trnF序列研究茶树及其近缘植物的亲缘关系。结果表明，龙井43叶绿体基因组全长为157096 bp，反向互补重复区（Inverted repeat, IR）为26080 bp，小单拷贝区（Small single copy region, SSC）、大单拷贝区（Large single copy region, LSC）分别为18283 bp、86653 bp。共注释叶绿体基因133个，其中蛋白编码基因86个，rRNA基因8个，tRNA基因39个。对所选植物的trnL-trnF序列进行比对，序列长度变异范围为481~501 bp，序列最长为岔河大茶，最短为金花茶，基于此序列构建亲缘关系树，山茶属茶组植物聚成一个组。研究结果对茶树优良品种培育及山茶属植物亲缘关系的研究具有重要价值。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈亮		108	1896	22.0	41.0
2	马春雷	中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心农业部茶树生物学与资源利用重点实验室	23	325	10.0	17.0
3	马建强	中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心农业部茶树生物学与资源利用重点实验室	10	89	4.0	9.0
4	刘声传	中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心农业部茶树生物学与资源利用重点实验室	2	26	2.0	2.0
5	陈春梅	中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心农业部茶树生物学与资源利用重点实验室	3	57	2.0	3.0