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摘要:
通过信息学方法对植物病原真菌分泌蛋白组进行预测以及对碳水化合物酶类CAZymes注释和比较,分析病原真菌寄生性与CAZymes家族功能的关系.结果显示非专性寄生(半活体营养型和死体营养型)真菌编码的分泌蛋白占基因组编码基因的比例较专性寄生真菌(活体营养型)的偏高;CAZymes家族中,非专性寄生真菌的糖基水解酶家族GH和多糖裂解酶家族PL较专性寄生真菌显著扩增;功能聚类分析发现,非专性寄生真菌参与纤维素、果胶、木聚糖等植物细胞壁组分降解相关的基因较专性寄生真菌明显增多.结果表明了CAZymes与寄生类型的高度关联性,揭示了其在非专性寄生真菌致病过程中可能的关键作用.
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文献信息
篇名 植物病原真菌寄生性与分泌蛋白组CAZymes的比较分析
来源期刊 植物病理学报 学科 农学
关键词 植物病原真菌 寄生性 分泌蛋白组 碳水化合物酶类 植物细胞壁降解
年,卷(期) 2014,(2) 所属期刊栏目 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
研究方向 页码范围 163-172
页数 10页 分类号 S432.4
字数 6217字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 戴小枫 中国农业科学院农产品加工研究所 75 1013 16.0 30.0
2 李蕾 中国农业科学院农产品加工研究所 24 866 11.0 24.0
3 陈捷胤 中国农业科学院农产品加工研究所 16 274 8.0 16.0
4 肖红利 中国农业科学院农产品加工研究所 5 41 3.0 5.0
5 陈相永 中国农业科学院农产品加工研究所 3 70 2.0 3.0
6 桂月靖 中国农业科学院农产品加工研究所 1 23 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
植物病原真菌
寄生性
分泌蛋白组
碳水化合物酶类
植物细胞壁降解
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
植物病理学报
双月刊
0412-0914
11-2184/S
大16开
中国农业大学植保楼406室
82-214
1955
chi
出版文献量(篇)
2207
总下载数(次)
3
总被引数(次)
36165
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导