花生叶全长cDNA文库的构建和部分表达序列标签分析

• 作者: 周双彪 唐荣华 庄伟建 张冲 熊发前 蔡铁城 邓烨 陈华
• 来源期刊: 《福建农林大学学报（自然科学版）》
• 关键词: 花生 SMART技术 全长cDNA文库 叶 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 596-601
• 页数: 6页
• 分类号: S565.2
• 语种: 中文

摘要

以‘闽花6号’品种为材料,利用SMART技术成功构建了花生叶不同生育时期混合的全长cDNA文库,并对文库的部分序列进行测序及分析.结果表明,该文库原始库容为2.25×106 cfu· mL-1,重组率达100％,插入片段大小为750-2000bp,平均插入片段大小为1000 bp,达到文库质量要求.随机挑选50个单克隆进行5'端测序,共获得50条有效序列.通过与NCBI非冗余蛋白质数据库进行比对和注释,获得已知功能基因或具推测功能的基因25个,未知功能基因14个,新基因11个,其中49个(98％)基因为花生未报道的基因.参与代谢过程和胁迫响应的基因表达量较高.