木霉属补充DNA条形码筛选

• 作者: 庄文颖 曾昭清 朱兆香
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 种内与种间序列差异 PCR扩增与测序成功率 rpb2
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1253-1262
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.140164

摘要

木霉属真菌是一类重要的生物资源,在工农业、环境保护等方面具有较高经济价值,对其进行快速、准确的物种鉴定兼具理论意义和应用前景.以木霉属35个概念清晰的种为材料,选择ITS、rpb2和tef1作为候选基因序列,利用TaxonGap对231个序列片段进行分析,将种内与种间序列差异以及序列获取难易程度作为评价指标,筛选该属的补充条形码片段.结果表明,rpb2具有适宜的种内与种间序列差异,其最小的种间差异(2.48％),大于最大种内差异(1.8％),种内、种间遗传距离存在明显的间隔区,并且该基因序列具有较高的PCR扩增与测序成功率(94.4％);ITS和tef1基因序列的种内与种间序列差异之间存在交叉重叠.因此建议rpb2作为木霉属的补充DNA条形码序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	庄文颖	中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室	80	430	12.0	17.0
2	曾昭清	中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室	17	51	4.0	6.0
3	朱兆香	中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室	7	70	4.0	7.0