池蝶蚌线粒体基因组全序列分析

• 作者: 彭扣 林巧惠 洪一江 王军花 盛军庆
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 池蝶蚌 线粒体基因组 序列分析 基因重排
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 页码范围: 320-327
• 页数: 8页
• 分类号: Q781
• 字数: 5528字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2014.46

摘要

采用普通PCR扩增、SHOT-GUN测序、软件拼接首次获得了池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)线粒体基因组全序列。线粒体基因组全长为15939 bp,由13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个SrRNA基因和28个长度为1-393 bp的非编码区组成；除ND3-ND5、ND4L、ATP6、ATP8、COX1-COX3、tRNA-D、tRNA-H之外,其他大多数基因在 L 链编码。池蝶蚌线粒体全基因组序列、蛋白编码基因、tRNA 基因、rRNA 基因及非编码区的A+T含量分别为60.36%、59.84%、61.7%、60.23%及62.5%,与其他淡水蚌类一致,均表现出A+T 偏好性,淡水蚌类线粒体基因组长度的差异主要表现在非编码区长度的差异。池蝶蚌 mtDNA 的COX2-12SrRNA区域基因排列存在差异,是ND3、tRNAHis、tRNAAla、tRNASer1、tRNASer2、tRNAGlu、ND2、tRNAMet 8个基因发生重组造成。22个tRNA基因都具有典型的三叶草二级结构, tRNA-E与 tRNA-W间的非编码区含有一个ORF区,而控制区并未发现。从GenBank上下载的14种双壳纲贝类的mtDNA序列构建的系统进化树,显示池蝶蚌与三角帆蚌亲缘关系最近。研究结果为淡水珍珠蚌线粒体基因重排及进化特征提供理论依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王军花	南昌大学生命科学与食品工程学院	50	354	9.0	16.0
2	洪一江	南昌大学生命科学与食品工程学院	92	677	16.0	20.0
3	盛军庆	南昌大学生命科学与食品工程学院	30	173	7.0	11.0
4	彭扣	南昌大学生命科学与食品工程学院	15	37	4.0	5.0
5	林巧惠	南昌大学生命科学与食品工程学院	4	13	2.0	3.0