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氟虫腈与斑马鱼GABAA及果蝇RDL受体作用的差异性研究
氟虫腈与斑马鱼GABAA及果蝇RDL受体作用的差异性研究
作者:
任天瑞
姚建华
汪小芬
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
同源建模
氟虫腈
斑马鱼γ-氨基丁酸A型受体
果蝇RDL受体
分子动力学模拟
摘要:
采用同源建模的方法构建了斑马鱼γ-氨基丁酸A型(GABAA)受体和果蝇RDL(resistance to dieldrin)受体跨膜区的三维结构,研究了氟虫腈在两个受体中作用位点的差异;采用分子对接和分子动力学方法,探讨了氟虫腈与斑马鱼GABAA受体和果蝇RDL受体的结合模式,并比较了氟虫腈与两个受体作用的差异性。结果表明:斑马鱼 GABAA受体和氟虫腈作用位点的结构与果蝇RDL受体和氟虫腈作用位点的结构存在一定的差异,果蝇 RDL 受体中的 Ala301对应斑马鱼GABAA受体α1亚基中的Val284和γ2亚基中的Ser306,氨基酸构象的差异较大;氟虫腈与斑马鱼GABAA受体的结合位点靠近胞内区一端,而与果蝇RDL受体的结合位点则位于受体第二跨膜区的Ala301~Leu308区域内。复合物分子动力学模拟结果表明,在模拟过程中,两个受体与氟虫腈复合物体系的势能可很快达到平衡状态。斑马鱼GABAA受体与氟虫腈之间形成4个氢键,其中概率大于60%的氢键有2个;而尽管果蝇RDL受体与氟虫腈形成了6个氢键,但只有1个氢键的概率大于50%,其复合物结合的稳定性比前者低。
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篇名
氟虫腈与斑马鱼GABAA及果蝇RDL受体作用的差异性研究
来源期刊
农药学学报
学科
化学
关键词
同源建模
氟虫腈
斑马鱼γ-氨基丁酸A型受体
果蝇RDL受体
分子动力学模拟
年,卷(期)
2014,(3)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
259-270
页数
12页
分类号
O641|O626.21|O629.7
字数
7218字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1008-7303.2014.03.04
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
姚建华
中国科学院上海有机化学研究所
38
97
6.0
7.0
2
任天瑞
上海师范大学生命与环境科学学院资源化学教育部重点实验室
67
299
9.0
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3
汪小芬
上海师范大学生命与环境科学学院资源化学教育部重点实验室
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同源建模
氟虫腈
斑马鱼γ-氨基丁酸A型受体
果蝇RDL受体
分子动力学模拟
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
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农药学学报
主办单位:
中国农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1008-7303
CN:
11-3995/S
开本:
大16开
出版地:
北京市海淀区圆明园西路2号中国农业大学理学院
邮发代号:
2-949
创刊时间:
1999
语种:
chi
出版文献量(篇)
2136
总下载数(次)
6
总被引数(次)
25567
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农药学学报2014年第2期
农药学学报2014年第1期
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