聚球藻Synechococcus sp.PCC7336基因组结构解析

• 作者: 刘汉明 李益 杨峰 饶妮妮
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 聚球藻 基因组 光合作用 信号传导 调控 进化
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 46-51
• 页数: 6页
• 分类号: Q933
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-311X.2014.04.0086

摘要

目的:对新测序菌株Synechococcus sp.PCC 7336的基因组结构分析.方法:利用多种生物信息学工具进行基本信息分析.构建本地比对数据库进行多序列比对分析.构建本地注释数据库进行基因、蛋白质功能分析.基于16S rRNA构建进化树对不同菌株进行聚类并分析进化差异.结果:GC含量为53.7％,共有5 096个蛋白质编码基因,47个RNA基因和不同类型的重复回文序列.与光合作用相关的基因分为9大类,信号传导以“双组分调控系统”为代表,11个次级代谢基因簇合成生物活性物质.进化分析显示其与传统聚球藻菌株差异较大,而与无类囊体蓝藻亲缘关系更密切.结论:Synechococcus sp.PCC 7336是聚球藻属中一个特殊的菌株,在基因组结构、基因数量、进化历程等方面都与其他菌株存在较大差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨峰		74	423	13.0	16.0
2	饶妮妮		54	440	12.0	18.0
3	李益		4	5	1.0	2.0
4	刘汉明		2	5	1.0	2.0