水分子间氢键判别标准的从头分子动力学模拟研究

• 作者: 潘章 纪青 陈静
• 来源期刊: 河北工业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 氢键 从头分子动力学 水二聚体 相互作用能
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 页码范围: 84-88
• 页数: 5页
• 分类号: Q51
• 字数: 4500字
• 语种: 中文

摘要

在统计水体系的氢键特征时,应用氢键的能量判别标准与几何判别标准存在着明显的差别.为了研究这一问题,应用从头分子动力学软件CPMD对水二聚体在不同构象下的相互作用能量进行了系统计算.计算结果表明当两个水分子的氢原子间距离dH…H＜2.0 (A)或受体氧原子与供体氢原子间距离rO…H＜1.62(A)时,水分子间的相互作用能由于排斥作用而显著增加.此时,虽然一些水分子对满足氢键的几何判据但两者间的相互作用能已经超出了氢键结合能判据的标准.因此本文建议在传统的氢键几何判别标准的基础上增加水分子间氢原子距离判据du…H,以及受体氧原子与供体氢原子间距离判据ro…H.这样可以有效的减少几何判别方法在统计水体系的氢键时产生的统计偏差,同时也可以使氢键的几何标准与结合能标准尽可能相一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	纪青	河北工业大学理学院	18	80	6.0	8.0
2	陈静	唐山学院基础部	17	50	4.0	6.0
3	潘章	唐山学院基础部	13	29	3.0	4.0