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摘要:
目的 对1例人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因进行序列鉴定.方法 采用QIAGEN快速DNA抽提试剂盒从外周血样本中提取基因组DNA,PCR方法扩增先证者HLA-C基因的第1外显子至第3内含子和第3内含子-3'非翻译区,PCR产物克隆转染到质粒载体中获得等位基因的单链,对所得克隆子进行第2、3和4外显子双向测序分析.结果 先证者样本克隆测序得到两个等位基因,其中一个等位基因为C* 03:04;另一个经BLAST验证为新的等位基因,序列已递交GenBank(KF049216).与最接近的C*01:03等位基因序列相比,新等位基因在第2外显子上有1个核苷酸不同,第316位C>A,导致第82位氨基酸由精氨酸变为丝氨酸(R82S).结论 该等位基因为HLA-C新等位基因,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-C* 01:78.先证者的HLA分型结果为A*02:07,24:02; B* 40:01,46:01; C* 01:78,03:04; DQB1* 05:02,05:02; DRB1* 16:02,16:02.
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文献信息
篇名 人类白细胞抗原新等位基因HLA-C*01:78的序列鉴定
来源期刊 中华医学遗传学杂志 学科
关键词 人类白细胞抗原 新等位基因 克隆 测序
年,卷(期) 2014,(4) 所属期刊栏目 群体遗传学研究
研究方向 页码范围 511-514
页数 4页 分类号
字数 3502字 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2014.04.023
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 邹红岩 广东省深圳市血液中心免疫遗传研究室 20 62 5.0 7.0
2 高素青 广东省深圳市血液中心免疫遗传研究室 20 52 4.0 7.0
3 徐筠娉 广东省深圳市血液中心免疫遗传研究室 9 6 1.0 1.0
4 王大明 广东省深圳市血液中心免疫遗传研究室 22 90 5.0 8.0
5 何柳媚 广东省深圳市血液中心免疫遗传研究室 13 20 3.0 4.0
6 甄建新 1 0 0.0 0.0
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人类白细胞抗原
新等位基因
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中华医学遗传学杂志
月刊
1003-9406
51-1374/R
大16开
成都市人民南路3段17号
62-163
1984
chi
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