植物咖啡碱合成酶的生物信息学分析

• 作者: 孔祥瑞 杨军 王让剑
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 咖啡碱合成酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（12）
• 页码范围: 1211-1218
• 页数: 8页
• 分类号: Q78|S571.1
• 字数: 3356字
• 语种: 中文

摘要

采用生物信息学分析方法对 GenBank 中来源于茶树、可可、山茶等植物咖啡碱合成酶的氨基酸序列进行比对分析，就等电点、亚细胞定位、信号肽、跨膜螺旋、保守性功能结构域及基序、二级结构与三级结构等重要参数进行预测与分析。结果表明，植物咖啡碱合成酶主要定位于胞质和胞核中，含有磷酸化、酰基化和糖基化修饰位点，基于基因序列与保守结构域可被分成3种类型，其中 I 型与 II 型酶蛋白均属全α型水溶性酶蛋白，III 型酶蛋白除二级结构富含无规卷曲构件，还极有可能存在信号肽序列，但3类酶蛋白均无跨膜螺旋，三级结构预测显示，I 型、II 型酶蛋白极为相似，由α螺旋和横向β-折叠片层组成，III 型则α螺旋位于横向两端，中间由纵向β-折叠片层连接。