基于LC-MS／MS策略建立十字花科黑腐病菌蛋白质表达谱的方法研究

• 作者: 于凯 付强 姜伯乐 岑卫健 甘永亮 韦宇拓
• 来源期刊: 广西科学
• 学科: 生物学
• 关键词: Xcc 蛋白质表达谱 LC-MS/MS LTQ-Orbitrap
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 酶学与微生物应用
• 页码范围: 103-107
• 页数: 5页
• 分类号: Q-331
• 字数: 3500字
• 语种: 中文

摘要

【目的】建立十字花科黑腐病菌（Xanthomonas campestris pv．campestris ，Xcc ）的蛋白质组学研究平台，用于分离、鉴定该菌的致病相关蛋白质。【方法】Xcc 8004经过液体培养，分别提取胞内蛋白质和胞外蛋白质，对所有蛋白质进行液体酶解，通过强阳离子交换色谱预分离多肽混合物，预分离后的馏分采用 EASY-nLC 结合LTQ-Orbitrap 质谱鉴定蛋白质表达谱。【结果】建立了基于 bottom-up 策略的蛋白质组鉴定方法，采用第一维离子交换预分离和第二维反相色谱分离结合，实现了高通量鉴定蛋白质组表达谱的技术体系。通过 SEQUEST 检索，在胞内蛋白质样品中共鉴定蛋白质数目为1595个，胞外蛋白质样品共鉴定蛋白质数目为1241个。【结论】建立的 LC-MS/MS 方法适合用于十字花科黑腐病菌蛋白质组学的研究，为研究微生物植物相互作用奠定了方法与理论基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韦宇拓		83	584	14.0	20.0
3	岑卫健		3	2	1.0	1.0
4	甘永亮	广西大学生命科学与技术学院	7	4	1.0	2.0
5	于凯	广西大学生命科学与技术学院	4	2	1.0	1.0
6	付强		7	32	3.0	5.0
9	姜伯乐		4	4	1.0	1.0