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基于COI基因5'端与3'端序列田间常见粉虱的分子鉴定
基于COI基因5'端与3'端序列田间常见粉虱的分子鉴定
作者:
万方浩
张桂芬
张金良
李小凤
田虎
陈苗苗
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
粉虱
COI基因
系统发育分析
遗传距离
物种鉴定
DNA条形码
摘要:
[目的]粉虱种类繁多,个体微小,其种类识别与鉴定常需借助分子生物学技术.本研究旨在明确线粒体COI基因(mitochondrial cytochrome c oxidase subunit Ⅰ gene)5'端和3'端序列对常见种类粉虱识别鉴定的可行性.[方法]以我国田间常见的16种粉虱为对象,以COI基因5'端(641 bp)和3'端(738 bp)序列为靶标进行比对分析,以MEGA 5.10软件的K2-P模型计算种内与种间遗传距离,以邻接法(NJ法)构建进化树并进行系统发育分析.[结果]当以5'端为靶标时,16种粉虱的种内平均遗传距离为0.0015,种间平均遗传距离为0.2897,种间遗传距离为种内遗传距离的193.1倍;而且种内、种间遗传距离没有重叠区域.当以3'端为靶标时种内平均遗传距离为0.0007,种间平均遗传距离为0.2817,种间遗传距离为种内遗传距离的402.4倍;但桑粉虱Pealius mori与烟粉虱Bemisia tabaci Asia Ⅱ 1的种内和种间遗传距离重叠.系统发育分析结果显示,以5'端为靶标时,16种粉虱可以形成独立的进化分支;以3'端为靶标时,除桑粉虱与传统分类学不一致外,其余种类均可形成独立的分支.[结论]结果表明,5'端序列更适用于基于DNA条形码技术的物种识别鉴定研究.
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篇名
基于COI基因5'端与3'端序列田间常见粉虱的分子鉴定
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
粉虱
COI基因
系统发育分析
遗传距离
物种鉴定
DNA条形码
年,卷(期)
2014,(4)
所属期刊栏目
进化与系统学
研究方向
页码范围
466-476
页数
分类号
Q966
字数
语种
中文
DOI
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张桂芬
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
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中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
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田虎
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
4
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李小凤
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期刊影响力
昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
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