消化性溃疡患者幽门螺杆菌cagA基因检测与分析

• 作者: 余鹏博 单婕 吴方雄 张婷 牛春燕 闫蓉 高保华
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 幽门螺杆菌 cagA基因 PCR 同源性 进化树
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 临床实验诊断研究
• 页码范围: 750-752
• 页数: 3页
• 分类号: R34
• 字数: 2738字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2014.10.08

摘要

目的 建立扩增幽门螺杆菌(Hp)cagA基因的高特异性方法,结合生物信息学方法分析并阐明cagA基因结构特点及地域起源特征.方法 在GenBank检索并下载cagA目标基因序列,设计引物.从消化性溃疡患者胃黏膜组织中提取总RNA,逆转录为cDNA,分段、多轮PCR扩增目的基因,ABI3500xl测序仪测定PCR产物核酸序列,ATCG基因分析软件拼接基因序列,ClustalX1.8序列分析软件比对参考序列和患者PCR扩增产物序列,Bioedit及Megalign基因软件分析核苷酸序列同源性,Mega4.1基因软件对分析序列构建进化树.结果 24例胃溃疡患者中有4例胃黏膜扩增出cagA基因片段.20例十二指肠溃疡患者中有2例胃黏膜扩增出cagA基因,均成功测序,命名为XA-cagA2-2.与本研究中目的基因同源性较高(同源性91.8％ ～ 97.0％)的菌株来源于泰国-菲律宾岛、日本冲绳岛人群菌株,进化关系较近的为泰国-菲律宾岛菌株、秘鲁亚马逊河的美国印第安人菌株以及日本冲绳岛菌株.结论 本研究建立的方法成功扩增出cagA目的基因全长序列,成功进行测序、同源性分析和进化树分析,为陕西省Hp cagA基因多态性及地域性特征研究提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	单婕	西安医学院附属医院内镜诊疗科	9	98	6.0	9.0
2	张婷	西安医学院附属医院内镜诊疗科	19	183	6.0	13.0
3	牛春燕	西安医学院附属医院消化内科	45	317	11.0	15.0
4	余鹏博		38	213	7.0	13.0
5	高保华	西安医学院附属医院消化内科	16	101	7.0	9.0
6	吴方雄	西安医学院附属医院消化内科	20	97	7.0	8.0
7	闫蓉	西安医学院附属医院消化内科	11	86	6.0	9.0