好客嗜酸两面菌W1寡营养酸性热泉环境的适应机制

• 作者: 姜成英 尤晓颜 张巧明 郑华军
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 好客嗜酸两面菌 基因组 寡营养 代谢 还原型无机硫化物
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 生态和环境微生物
• 页码范围: 1193-1203
• 分类号: X172
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.2014.10.012

摘要

[目的]从基因组水平揭示好客嗜酸两面菌(Acidianus hospitalis)W1对寡营养酸性热泉环境的适应机制.[方法]使用NCBI非冗余蛋白数据库、Uniport蛋白数据库以及Sulfolobus数据库对好客嗜酸两面菌W1基因组序列进行功能注释,使用KEGG数据库对基因组进行In slico代谢途径重构,在此基础之上,采用比较基因组学方法对代谢途径进行鉴定和完善.[结果]好客嗜酸两面菌W1具备多样化的代谢方式以适应寡营养酸性热泉环境.W1菌株通过3-羟基丙酸/4-羟基丁酸和乙二酸-4-羟基丁酸循环进行CO2固定、通过氧化还原型无机硫化物(Reduced inorganic sulfur compounds,RISCs)获取能量营自养型生长.但W1菌株与模式菌株Acidianus ambivalens的硫代谢方式不同,W1基因组中缺少编码亚硫酸-受体氧化还原酶(SAOR)、腺苷硫酸(APS)还原酶、硫酸腺苷酰转移酶(SAT)和腺苷硫酸:磷酸腺苷转移酶(APAT)的基因.此外,W1菌株可以通过非磷酸化的分支的ED途径和TCA循环进行葡萄糖代谢,糖类和氨基酸转运蛋白以及相应水解酶的存在表明W1能够利用部分有机物营兼性自养型生长.与A.ambivalens不同,W1菌株不能利用H2作为电子供体.[结论]多样化的代谢方式为好客嗜酸两面菌W1更好地适应寡营养酸性热泉环境提供了重要保障,对于W1菌株特有代谢方式的揭示也丰富了对于嗜酸两面菌(Acidianus)属物种代谢多样性的认知.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姜成英	中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室	21	263	9.0	16.0
2	张巧明	河南科技大学食品与生物工程学院	17	74	5.0	8.0
3	尤晓颜	河南科技大学食品与生物工程学院	16	47	4.0	5.0
4	郑华军		4	9	2.0	3.0