乌金猪FTO基因的克隆和表达分析

• 作者: 俞政全 李永能 杨明华 毕保良 潘洪彬 赵素梅 高士争 黄英
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 乌金猪 FTO基因 生物信息学 组织表达谱
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 316-322
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|Q811.4
• 字数: 3855字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2014.03.003

摘要

目的:克隆乌金猪脂肪和肥胖相关基因(FTO)编码区序列(CDS),分析其序列组成特征及在乌金猪不同组织中的表达情况.方法:采用反转录PCR方法从乌金猪脂肪组织中克隆FTO基因CDS,利用生物信息学方法分析其序列组成特征;采用实时PCR方法分析乌金猪FTO基因mRNA在不同组织中的表达情况.结果:克隆的FTO基因全长1518 bp(已提交至GenBank数据库,登录号为JQ031263),编码由505个氨基酸残基构成的蛋白,推测的相对分子质量为58.16×103,等电点为5.18;乌金猪与牛、羊、人和大鼠的FTO蛋白的氨基酸序列同源性分别为91％、90％、89％和83％;进化树分析显示,推测的乌金猪FTO蛋白的氨基酸组成与牛、羊的亲缘性较近,其次是人、大鼠;推测的氨基酸组成中无跨膜区,无信号肽,为亲水蛋白;分析发现该蛋白有22个磷酸化修饰位点,包括10个丝氨酸蛋白激酶磷酸化位点、7个苏氨酸蛋白激酶磷酸化位点、5个酪氨酸蛋白激酶磷酸化位点,200、246、302位氨基酸残基有糖基化位点;二级结构预测发现该蛋白共有201个螺旋、33个伸展链和271个卷曲结构;实时PCR检测的组织表达谱表明,FTO基因mRNA在乌金猪肝脏组织中的表达量最高,在脂肪、肾、脾中也有大量表达,在心脏、肌肉中的表达量最少.结论:为深入探讨乌金猪FTO基因的生物学功能奠定了重要基础.