高分辨率熔解曲线法在BIM基因2,903 bp片段插入/缺失检测中的应用

• 作者: 夏金晶 李蓉 熊丽纹 白浩 邵敏华 韩宝惠 颜波
• 来源期刊: 中国肺癌杂志
• 关键词: 高分辨率熔解曲线法 BIM基因 肺肿瘤
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 238-242
• 页数: 5页
• 字数: 2440字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3779/j.issn.1009-3419.2014.03.10

摘要

背景与目的 BIM基因编码的蛋白属于BCL2蛋白家族的成员，作为凋亡调控因子参与多种细胞活动。BIM基因上2,903bp的插入缺失片段与非小细胞肺癌EGFR-TKI靶向用药的获得性耐药相关。建立并优化HRM方法有助于快速、准确地检测BIM基因2,903 bp片段的缺失，为临床工作提供指导性的意见。本研究建立与稳定了HRM的检测方法，并在30例肺癌样本以及30例正常对照样本中检测BIM基因缺失情况。方法设计、合成针对BIM基因片段缺失的引物，优化高分辨率熔解曲线（high resolution melting, HRM）分析方法。并选取部分样本通过普通PCR方法和直接测序法检测BIM基因缺失情况。野生型模板扩增产物其解链温度要高于缺失型产物的解链温度。野生型和缺失型产物的熔解曲线可见明显差异，相应的Tm值相差约2.5 oC。结果经过HRM基因突变分析方法，在30例肺癌样本中检测到1例为BIM基因纯合缺失型，7例为杂合缺失型，22例为野生型。在30例正常对照样本中检测，2例为杂合缺失型，28例为野生型。结论本研究建立的对BIM基因片段缺失的高分辨率熔解曲线法是一种，灵敏、准确、快速、高通量的方法。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	夏金晶	上海交通大学医学院附属上海市胸科医院呼吸内科	3	23	3.0	3.0
2	熊丽纹	上海交通大学医学院附属上海市胸科医院呼吸内科	17	123	5.0	10.0
3	李蓉	上海交通大学医学院附属上海市胸科医院呼吸内科	11	22	3.0	4.0
4	颜波	上海交通大学医学院附属上海市胸科医院呼吸内科	10	22	3.0	4.0
5	白浩	上海交通大学医学院附属上海市胸科医院呼吸内科	1	4	1.0	1.0
6	邵敏华	上海交通大学医学院附属上海市胸科医院呼吸内科	1	4	1.0	1.0