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鸡IGFBP2基因3'UTR区1196C>A单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析
鸡IGFBP2基因3'UTR区1196C>A单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析
作者:
乔书培
于莹莹
孙婴宁
宋鹤
张潇飞
李辉
王宁
闫晓红
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
鸡
IGFBP2基因
单核苷酸多态性
3'非编码区
gga-miR-456-3p
摘要:
鸡IGFBP2基因3'非编码区(3'UTR) 1196C>A单核苷酸多态性(SNP)与鸡的腹脂重和腹脂率显著相关.生物信息学分析显示,该SNP恰好位于gga-miR-456-3p的一个潜在靶基因结合位点处,提示IGFBP2基因可能是gga-miR-456-3p的一个靶基因,且该SNP位点可能影响gga-miR-456-3p对IGFBP2基因表达的调控作用.为鉴定SNP 1196C>A是否为功能性SNP,本研究分别构建了包含该SNP位点C或A等位基因的双荧光素酶报告基因载体,比较分析这两个等位基因在鸡胚成纤维细胞系(DF1)和鸡前脂肪细胞中对报告基因活性和表达的影响;利用miRNA mimics和inhibitor分析gga-miR-456-3p对不同等位基因报告基因活性以及内源性IGFBP2表达的影响.结果发现,在DF1细胞和鸡前脂肪细胞中,A等位基因的报告基因活性和表达均显著高于C等位基因(P< 0.05); gga-miR-456-3p仅影响C等位基因的报告基因活性和表达,而对A等位基因的报告基因活性没有明显影响;gga-miR-456-3p调控细胞内源性IGFBP2基因的mRNA和蛋白质表达.本研究证实IGFBP2基因是gga-miR-456-3p的靶基因,其3'UTR区SNP 1196C>A是一个功能性SNP,它影响gga-miR-456-3p对鸡IGFBP2基因的表达调控作用.本研究结果对于鸡的分子辅助选择育种及IGFBP2基因在脂肪沉积中调控机制的阐明具有重要意义.
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文献信息
篇名
鸡IGFBP2基因3'UTR区1196C>A单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析
来源期刊
生物化学与生物物理进展
学科
关键词
鸡
IGFBP2基因
单核苷酸多态性
3'非编码区
gga-miR-456-3p
年,卷(期)
2014,(11)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1163-1172
页数
10页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1206.2014.00062
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李辉
142
1989
22.0
39.0
2
王宁
44
210
7.0
13.0
3
孙婴宁
3
0
0.0
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宋鹤
3
0
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0.0
5
张潇飞
3
0
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0.0
6
闫晓红
11
64
4.0
8.0
7
于莹莹
3
0
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乔书培
2
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传播情况
被引次数趋势
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2014(1)
参考文献(1)
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2014(1)
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二级引证文献(0)
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节点文献
鸡
IGFBP2基因
单核苷酸多态性
3'非编码区
gga-miR-456-3p
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
生物化学与生物物理进展
主办单位:
中国科学院生物物理研究所
中国生物物理学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3282
CN:
11-2161/Q
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区大屯路15号中国科学院生物物理研究所内
邮发代号:
2-816
创刊时间:
1974
语种:
chi
出版文献量(篇)
3726
总下载数(次)
14
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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