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昆虫JHE基因结构及与甲基化相关的CpG O/E值分析
昆虫JHE基因结构及与甲基化相关的CpG O/E值分析
作者:
周晓穗
张梅
李广宏
梁士可
王方海
陈佳林
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
保幼激素酯酶
DNA甲基化
基因结构
CpG O/E值
外显子
摘要:
本研究选择西方蜜蜂Apis mellifera、黑腹果蝇Drosophila melanogaster、致倦库蚊Culex quinquefasciatus和家蚕Bombyx mori 4种昆虫为例,以降解保幼激素的特异性酯酶(juvenile hormone esterase,JHE)为研究对象,首先运用NCBI的Spidey在线软件将各昆虫的JHE基因与其相应的基因组序列作比对,分别确定各昆虫JHE基因的上游2000 bp的具体序列和外显子及内含子区域.发现西方蜜蜂JHE基因含有7个外显子和6个内含子,而其余三种昆虫的JHE基因均含有6个外显子和5个内含子.接着,分别统计基因各区域的CpG,G,C位点的占有量,并计算出CpG O/E值(CpG位点的实际值与期望值之间的比值),发现各区域CpG O/E平均值的大小依次为:基因上游2000 bp区>内含子区>外显子区,基因上游2000 bp区的CpG O/E平均值大于1.0,而第1到第4外显子的CpGO/E平均值均只有0.8左右.表明在昆虫JHE基因中,若有CpG甲基化位点发生,应主要发生在第1到第4外显子区域.
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篇名
昆虫JHE基因结构及与甲基化相关的CpG O/E值分析
来源期刊
环境昆虫学报
学科
农学
关键词
保幼激素酯酶
DNA甲基化
基因结构
CpG O/E值
外显子
年,卷(期)
2014,(5)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
705-710
页数
分类号
Q965|S433.89
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-0858.2014.05.7
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
环境昆虫学报
主办单位:
广东省昆虫学会中国昆虫学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1674-0858
CN:
44-1640/Q
开本:
16开
出版地:
广州市新港西路105号
邮发代号:
46-18
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
2184
总下载数(次)
4
总被引数(次)
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