昆虫JHE基因结构及与甲基化相关的CpG O/E值分析

• 作者: 周晓穗 张梅 李广宏 梁士可 王方海 陈佳林
• 来源期刊: 环境昆虫学报
• 学科: 农学
• 关键词: 保幼激素酯酶 DNA甲基化 基因结构 CpG O/E值 外显子
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 705-710
• 分类号: Q965|S433.89
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-0858.2014.05.7

摘要

本研究选择西方蜜蜂Apis mellifera、黑腹果蝇Drosophila melanogaster、致倦库蚊Culex quinquefasciatus和家蚕Bombyx mori 4种昆虫为例,以降解保幼激素的特异性酯酶(juvenile hormone esterase,JHE)为研究对象,首先运用NCBI的Spidey在线软件将各昆虫的JHE基因与其相应的基因组序列作比对,分别确定各昆虫JHE基因的上游2000 bp的具体序列和外显子及内含子区域.发现西方蜜蜂JHE基因含有7个外显子和6个内含子,而其余三种昆虫的JHE基因均含有6个外显子和5个内含子.接着,分别统计基因各区域的CpG,G,C位点的占有量,并计算出CpG O/E值(CpG位点的实际值与期望值之间的比值),发现各区域CpG O/E平均值的大小依次为:基因上游2000 bp区＞内含子区＞外显子区,基因上游2000 bp区的CpG O/E平均值大于1.0,而第1到第4外显子的CpGO/E平均值均只有0.8左右.表明在昆虫JHE基因中,若有CpG甲基化位点发生,应主要发生在第1到第4外显子区域.