龙眼胚性愈伤组织DlRan3A和DlRan3B基因启动子的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 林玉玲 王天池 田奇琳 赖钟雄
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 龙眼 体胚发生 Ran基因 启动子 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 82-89
• 页数: 8页
• 分类号: S667.2
• 字数: 7581字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.01.014

摘要

植物Ran蛋白与核质运输、微管形成等过程密切相关.通过Tail-RCR结合接头连接介导PCR法克隆了龙眼胚性愈伤组织(Embryogenic callus,EC)Ran家族DlRan3A和DlRan3B基因的5’调控序列,长度分别为1276和714 bp.结合生物信息学法,分析启动子的转录起始位点和顺式作用元件.结果表明:龙眼EC DlRan3A和DlRan3B基因启动子分别存在1处和3处转录起始位点,且除了含有TATAbox和CAAT box等基本顺式作用元件外,还含有多个光响应元件、激素应答元件、防御与逆境胁迫响应元件等.龙眼EC DlRan3A和DlR an3B启动子转录活性可能受到光、激素信号及逆境胁迫因素的诱导,在龙眼体胚发生过程中的信号转导应答过程中发挥重要作用.此外,在DlRan3A启动子区预测到1个长度为214 bp的CpG岛,为后续研究该基因启动子甲基化水平及分子调控机制提供了线索.龙眼EC Ran基因启动子的克隆与生物信息学分析有助于揭示Ran在体胚发生过程中的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0
3	王天池	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	12	42	4.0	6.0
4	田奇琳	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	8	51	4.0	7.0