达氏鳇肌肉组织转录组测序和功能分析

• 作者: 石振广 赵文 高峰英
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 达氏鳇 肌肉组织 基因 转录组
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 页码范围: 1255-1262
• 分类号: Q785|S965.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2014.49165

摘要

为发掘达氏鳇的功能基因,采用新一代高通量测序技术对达氏鳇肌肉组织转录组进行测序.结果获得原始数据14 447 211 200 bp,拼接获得了55 531条单基因序列(unigene),长度范围300.32 613 bp,平均长度941 bp.利用生物信息学方法对unigene进行了非冗余蛋白质数据库(Nr)相似搜索,此外还进行了GO的功能注释和KEGG代谢通路分析.结果一共有20 735条unigene(37.34％)与Nr数据库中的己知基因同源;根据GO功能可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类56分支;依据KEGG代谢通路分析可以分成290类.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵文	大连海洋大学辽宁省水生生物学重点实验室	96	593	13.0	18.0
2	高峰英	大连海洋大学辽宁省水生生物学重点实验室	3	12	1.0	3.0
3	石振广		5	24	3.0	4.0