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摘要:
目的:初步筛选淮安食管鳞癌与癌旁组织中差异表达的LncRNAs,为进一步研究lncRNAs在食管鳞癌发病机制中的作用奠定基础。方法:分别提取3例患者食管癌组织及配对癌旁组织的总RNA,体外逆转录制备并标记为双链cDNA(ds-cDNA),与人类LncRNA表达谱芯片进行杂交,经扫描后,用Agilent GeneSpring GX v11.5.1软件进行分析运算,筛选出差异表达的LncRNAs。qRT-PCR分析LncRNA在食管癌细胞及组织中的表达情况。结果:按照倍数≥2.0、P≤0.05的标准,筛选出表达差异有统计学意义的LncRNAs共1019个,其中399个上调,620个下调。GO分析和通路分析结果显示这些LncRNAs调控的差异表达的mRNAs主要与细胞周期、细胞分化、蛋白酶的活动等有关。结合Gibb食管癌相关的LncRNA差异表达谱分析发现lncRNA-UCA1可能参与食管癌发生发展。qRT-PCR结果显示,与永生化食管上皮细胞及癌旁组织相比,食管癌细胞及食管癌组织中lncRNA-UCA1均表达下调。结论:共筛选出淮安食管鳞癌与癌旁组织中1019个差异表达LncRNAs,其中LncRNAs-UCA1可能成为食管癌早期发现和诊断的生物标志物。
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关键词云
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文献信息
篇名 LncRNA-UCA1与淮安食管癌发病风险的初步研究
来源期刊 癌变·畸变·突变 学科 医学
关键词 食管癌 LncRNA-UCA1 实时荧光定量PCR 肿瘤分子标志物
年,卷(期) 2014,(6) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 407-411,418
页数 6页 分类号 R730.4
字数 3995字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1004-616x.2014.06.002
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 浦跃朴 东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室 176 2029 25.0 35.0
2 尹立红 东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室 139 1526 20.0 32.0
3 刘冉 东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室 43 213 9.0 12.0
4 杨淼 东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室 7 42 4.0 6.0
5 李夏君 东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室 1 1 1.0 1.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
食管癌
LncRNA-UCA1
实时荧光定量PCR
肿瘤分子标志物
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
癌变·畸变·突变
双月刊
1004-616X
44-1063/R
大16开
广东省汕头市新陵路22号汕头大学医学院内
80-285
1989
chi
出版文献量(篇)
2510
总下载数(次)
3
总被引数(次)
11449
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导