用于脉冲场凝胶电泳指纹图谱分析的分区条带计数法的建立

• 作者: 宋元君 屠丽红 张曦 陈敏 陈洪友
• 来源期刊: 上海预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 分子分型 指纹图谱 脉冲场凝胶电泳
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 465-468
• 页数: 4页
• 分类号: R37
• 字数: 3385字
• 语种: 中文

摘要

[目的]建立操作简便、软件依赖性低、结果易于交流的脉冲场凝胶电泳（ PFGE）指纹图谱分析新方法。[方法]按PulseNet标准操作规程，对44株副溶血性弧菌进行PFGE分型试验，分别利用分区条带计数法和BioN-umerics软件对图谱进行分析，并以型别数、成簇数和Simpson’ s多样性指数（ DI）对2种分析方法进行比较。[结果]分区条带计数法可将44株菌分为32个型（DI＝97．6％），能发现5簇。 BioNumerics 聚类分析可分为29个BN型（DI＝95．5％），能发现4簇。在发现菌株成簇的能力上，2种分析方法的差异无统计学意义。[结论]条带计数法能大大减少肉眼观察的图谱数量，具有操作简便、成本低、对软件依赖性小、结果显示简单直接的特点，能直观反映菌株条带的分布特征，因此应能满足分型信息共享与交流的要求。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张曦		75	451	12.0	17.0
2	陈敏		92	691	15.0	20.0
3	陈洪友		42	199	9.0	11.0
4	屠丽红		27	130	7.0	9.0
5	宋元君		8	58	5.0	7.0