大口黑鲈高密度脂蛋白结合蛋白基因(HBP)SNPs的筛选及与生长性状关联性分析

• 作者: 周春龙 李胜杰 樊佳佳 白俊杰 马冬梅
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 大口黑鲈 单核苷酸多态性(SNP) 高密度脂蛋白结合蛋白基因(HBP) 单倍型 双倍型
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 232-238
• 页数: 7页
• 字数: 4269字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2014.02.013

摘要

高密度脂蛋白结合蛋白(high density lipoprotein binding protein,HBP)在动物的脂肪代谢中发挥重要的作用.脂类是鱼类的重要能源物质,尤其是那些对糖类利用率很低的肉食性鱼类.HBP基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)可能会影响脂肪代谢,而对大口黑鲈的生长性状产生影响,研究其SNP与生长性状的相关性可为其分子标记辅助选择提供候选标记.本研究根据大口黑鲈(Micropterus salmoides) EST-SNP库中HBP基因的序列(GenBank accession No.KF652241),用直接测序法在HBP基因3’非编码区获得了3个SNPs位点:H1(G+2782T),H2(T+2817C)和H3(G+2857A);随机选择同批繁殖、同塘养殖的165尾大口黑鲈样本,对3个SNPs位点用SnaPshot方法进行检测和分型,分型结果用软件Popgene32进行遗传结构分析;运用软件spss17.0的一般线性模型(general linear model,GLM)对获得的不同基因型与生长性状进行关联分析.结果表明,3个位点均处于哈温平衡,其中H1和H2位点组成了两种单倍型(A和B),观测到3种基因型(AA、AB和BB);H1、H2和H3共组成6种双倍型(D1、D2、D3、D4、D5和D6).不同基因型与生长性状的相关性分析显示,基因型BB在体质量和全长形态指标显著高于基因型AB(P＜0.05),双倍型D6在体质量和全长形态指标显著高于双倍型D4(P＜0.05).本研究在大口黑鲈HBP基因3’非编码区获得了与生长性状相关的SNPs标记,可应用于大口黑鲈分子标记辅助选择育种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白俊杰	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	104	1312	20.0	28.0
2	樊佳佳	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	15	75	5.0	8.0
3	李胜杰	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	36	249	10.0	14.0
4	周春龙	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	1	14	1.0	1.0