禽流感病毒基因的密码子偏好性及聚类分析

• 作者: 宋乔乔 柴志欣 钟金城
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 禽流感病毒 密码子偏好性 系统进化
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 48-53
• 页数: 6页
• 分类号: Q939.47|Q527+.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-311X.2014.02.0038

摘要

目的:研究禽流感病毒基因的密码子偏好性及进化关系,为禽流感的防控和疫苗开发提供理论基础.方法:运用多种生物信息学分析软件,对17种流感亚型病毒基因进行密码子偏好性及聚类分析.结果:H7N9亚型禽流感病毒基因偏好使用UUC、CUU、CUC、AUA、UCU、ACU、CAA和UGC等8个密码子.聚类分析表明,H7N9病毒与H7N3、H5N1、H9N2、H11N9病毒的亲缘关系最近;不同年份的H7N9亚型禽流感病毒中,H7N9(2013)病毒与H7N9(2009)病毒的亲缘关系最近,而与其他年份发生的H7N9病毒的亲缘关系均较远.结论:H7N9亚型禽流感病毒在碱基组成上偏爱使用以A或U结尾的密码子,具有独特的密码子使用特性;H7N9(2013)病毒并不是起源于以往发生过的H7N9病毒的突变,而是随病毒进化出现的新重配病毒.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟金城		92	727	16.0	22.0
2	柴志欣		22	45	4.0	6.0
3	宋乔乔		3	0	0.0	0.0