2种枇杷属植物的trnH-psbA条形码序列变异及其近缘属系统发育初步研究

• 作者: 胡文舜 蒋际谋 许奇志 郑少泉 陈秀萍 黄爱萍
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 枇杷属 trnH-psbA DNA条形码 序列分析 系统进化
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种、作物营养与栽培
• 页码范围: 12-16
• 页数: 5页
• 分类号: S667.3
• 字数: 3457字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.01.003

摘要

选用枇杷野生近缘种‘栎叶枇杷’和栽培种‘早钟6号’、‘香妃’,对其叶绿体基因组trnH-psbA基因间隔区进行PCR克隆与测序,利用生物信息学方法分析其序列特征,并构建苹果亚科内19个属的系统发育树.结果表明:trnH-psbA序列长323～392 bp(GenBank登录号:KF022254、KF022255、KF022256),G+C含量30.10％～33.13％,共有1个核苷酸替换(substitution)和2个插入/缺失(indel);基于tmH-psbA DNA条形码序列的分子系统进化分析结果表明,苹果亚科内形成2个大的分支,枇杷属与石斑木属的亲缘关系最近(平均遗传距离为0.055).此结果表明叶绿体基因trnH-psbA序列可有效地进行枇杷属内物种鉴别及属间分类,是枇杷属植物DNA条形码研究的标准基因之一.