凝胶条带内DNA回收测序评估DGGE可靠性

• 作者: 余育和 倪加加
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: DGGE可靠性指数 DNA指纹 变性梯度凝胶电泳 微生物群落结构
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 页码范围: 454-458
• 页数: 5页
• 分类号: Q-331
• 字数: 3692字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2014.64

摘要

为了评估DGGE的可靠性，对DGGE条带中回收的DNA片段进行了测序比较分析，并引入了DGGE可靠性指数的概念评价其可靠性。结果显示同一条DGGE条带回收的DNA来自同一属的概率为64.7%，相同位置的DGGE条带可以被认为是同一OTU；不同的DGGE条带回收到类似的DNA序列(16S rDNA V3区差异小于4 bp)的概率为10.5%；DGGE可靠性指数为74.8%。以上结果表明尽管DGGE技术与理论预期存在一定的差距，但是DGGE技术基本能够反映微生物群落的多样性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余育和	中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室	52	738	16.0	25.0
2	倪加加	中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室	4	23	3.0	4.0