赤桉EcWRKY50转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴幼媚 张照远 杨利平 王鹏良 蔡玲 覃子海 覃柳辉 韦翠娥 黄金使
• 来源期刊: 农业研究与应用
• 关键词: 赤桉 EcWRKY50转录因子 基因电子克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 9-16
• 页数: 8页
• 字数: 3149字
• 语种: 中文

摘要

WRKY转录因子参与植物生长发育、抗病虫、耐逆境等众多过程,并在其中起重要作用.为了研究WRKY在赤桉中的结构和功能,本研究利用电子克隆的方法克隆了赤桉与AtWRKY50高度同源的一个WRKY基因Ec WRKY50,并利用生物信息学方法对该基因编码蛋白的氨基酸组成,理化性质,亚细胞定位和高级结构等方面进行预测和分析.结果表明,Ec WRKY50基因全长为585 bp,包含一个480 bp的开放阅读框,编码159个氨基酸,该基因蛋白分子量为18.187KD,理论等电点为5.45.该蛋白含有一个WRKYGKK的保守结构域和C2H2结构域,属于GroupⅡc成员,很可能在细胞质中起转录和转录调控的作用;并对该蛋白进行了同源性分析.这些研究为该基因功能的进一步分析奠定了坚实的基础.