亚心型扁藻叶绿体psbA基因的克隆及序列分析

• 作者: 侯士昌 唐志红 崔玉琳 温少红 秦松
• 来源期刊: 生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 亚心型扁藻(Platymonas subcordiformis) PCR步移 psbA基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-4,14
• 页数: 5页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 3066字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1736.2014.01.001

摘要

psbA基因是叶绿体基因组中一个重要的光调控基因,编码光和系统Ⅱ反应中心的D1蛋白.根据叶绿体基因组序列高度保守的特性,利用莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)psbA基因的保守序列(基因登录号:HQ667991.1)设计引物,采用PCR步移的方法从亚心型扁藻(Platymonas subcordiformis)基因组DNA中克隆到psbA基因全长(基因登录号:KF528742).序列分析表明,亚心型扁藻psbA基因全长1939 bp,编码区长度为1062 bp,推导编码353个氨基酸,包括4个赖氨酸残基.有效密码子数显示psbA基因具有明显的密码子偏好性,并且偏好使用以A/T结尾的密码子.相对同义密码子使用度表明25个密码子在编码使用时具有偏好性,其中20个密码子以A/T碱基结尾,占到80%.其终止密码子使用了TAG.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐志红	烟台大学生命科学学院	23	161	7.0	12.0
2	温少红	烟台大学生命科学学院	24	393	13.0	19.0
3	秦松	中国科学院烟台海岸带研究所	179	1772	22.0	33.0
4	崔玉琳	中国科学院烟台海岸带研究所	9	18	2.0	4.0
5	侯士昌	烟台大学生命科学学院	3	27	2.0	3.0