建鲤ODC1基因型与增重的相关性分析

• 作者: 俞菊华 唐永凯 李建林 李红霞
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 建鲤 鸟氨酸脱羧酶 基因型 SNP-增重相关分析
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 页码范围: 414-421
• 页数: 8页
• 分类号: Q344+.1
• 字数: 4837字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2014.59

摘要

构建了建鲤(Cyprinus carpio var. jian)鸟氨酸脱羧酶(Ornithine decarboxylase, ODC) jlODC1a基因上6个和jlODC1b基因上4个SNP位点的PCR-RFLP方法,检测了这10个位点在12个家系约900尾建鲤选育群体中的基因型,各位点的基因型频率存在差异,最小等位基因频率(MAF)为0.14-0.48。各位点不同基因型与增重相关分析结果,其中7个 SNPs 与建鲤增重显性相关的位点, ODC1s 基因上与雌鱼增重相关的SNP位点(7个)较雄鱼(4个)多。标记富集结果表明富集与建鲤增重相关的优势基因型的SNP个数越多的个体增重速度越快 SNP 个数越多的个体增重速度越快,富集4个的平均增重显著快于富集0-3的个体增重,且比0标记的快约14%,这反映出生长为数量性状。进一步对所检测位点进行双倍型分析,结果显示具有四个优势基因型且全部杂合优势基因型的4567(XXXXXXACCTCTCT)组的增重最快,比0优势基因型的增重快达26.6%,可以考虑用于今后的快增长建鲤的选育计划中。此外,双倍型分析结果还表明,不同位点之间可能存在或颉抗或协同的互作,如1和4之间存在拮抗关系,因此在今后的选育计划中,在考虑标记富集的情况下还应考虑标记之间的关系。宜在选择互为协同作用优势基因型的前提下,富集尽可能多的SNP标记。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李建林	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室	38	631	15.0	24.0
2	唐永凯	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室	28	459	11.0	21.0
3	俞菊华	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室	38	655	17.0	24.0
4	李红霞	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室	14	131	7.0	11.0