辣椒种质资源ITS与系统进化分析

• 作者: 徐小万 徐晓美 李涛 李颖 王恒明 罗少波
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 ITS序列 系统进化
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 蔬菜
• 页码范围: 881-888
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文

摘要

以核糖体DNA内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,rDNA ITS区)作为DNA条形码对辣椒进行系统进化分析.利用收集的17份辣椒资源,提取总DNA,进行PCR扩增和测序,并从GenBank下载辣椒属的主要栽培种浆果状椒(Capsicum baccatum)、茸毛椒(Cpubescens)、灌木状辣椒(C.frutescens)和野生种(C.eximium)、野生种(C.lycianthoides)的ITS序列,进行系统进化与亲缘关系分析.结果表明,以野生种(C.eximium)的ITS序列为参考序列,利用Clustalx 2.1软件进行比对,发现3个中华辣椒、茸毛椒和灌木状辣椒在ITS1区有15个碱基缺失.以茄科番茄属(lycopersicon)栽培种‘上海906’作为外类群,在进化树标尺约0.11处,22个辣椒属ITS序列可分为6个分支.全部一年生辣椒(14个)聚在一支.中华辣椒(3个)和灌木状辣椒聚在一支,表明中华辣椒与灌木状辣椒亲缘关系相对较近.野生种(C.eximium)、浆果状椒、茸毛椒和野生种(C.lycianthoides)分别单独为一支.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李颖	广东省农业科学院蔬菜研究所	69	838	13.0	27.0
2	王恒明	广东省农业科学院蔬菜研究所	58	656	12.0	24.0
3	徐小万	广东省农业科学院蔬菜研究所	44	281	8.0	14.0
4	罗少波	广东省农业科学院蔬菜研究所	82	637	14.0	21.0
5	徐晓美	广东省农业科学院蔬菜研究所	11	31	2.0	5.0
6	李涛	广东省农业科学院蔬菜研究所	21	79	5.0	8.0