京海黄鸡繁殖性状与29个多态位点的关联性

• 作者: 张涛 张跟喜 樊庆灿 王文浩 王永娟 王金玉 顾玉萍
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 京海黄鸡 繁殖性状 全基因组关联分析(GWAS) 单核苷酸多态(SNP)
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1269-1276
• 页数: 8页
• 字数: 5502字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2014.10.010

摘要

为了寻找影响鸡(Gallus gallus)繁殖性状的候选基因,本研究利用单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片分型技术,利用已报道的影响鸡繁殖性状的29个位点对396只京海黄鸡母鸡的29个位点直接进行SNP分型,并对11个繁殖性状进行关联分析.结果发现,29个SNP中,有12个SNP与至少1个繁殖性状关联显著(P＜0.05),其中有7个SNP同时与2个繁殖性状关联显著(P＜0.05).所有繁殖性状中,与京海黄鸡开产体重关联显著的SNP有1个,与京海黄鸡462 d产蛋数关联显著的SNP有2个,与蛋重关联显著的SNP有6个,与开产体重关联显著的SNP有6个,与综合选择指数关联显著的SNP有2个,与后代健雏率关联显著的SNP有1个,没有发现与300 d产蛋数、300～462 d产蛋数和后代孵化率关联显著的SNP.同时,根据这些位点的群体遗传参数发现,12个SNP的平均多态信息含量偏低,说明京海黄鸡有持续选育提高的可能性和必要性.大部分有利基因型为纯合基因型,但有部分基因型为杂合基因型.对与12个SNP最近的功能基因犰狳(Priodontes maximus)重复基因(armadillo repeat gene deleted in velocardiofacial syndrome,ARVCF)、集落刺激因子3受体基因(colony stimulating factor 3 receptor,CSF3R)和ODZ同源物2基因(odz,odd Oz/ten-m homolog 2,ODZ2)的功能探讨发现,这些基因可以通过不同的途径影响鸡的繁殖性状.本研究为鸡繁殖性状候选基因的进一步研究提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王金玉	扬州大学动物科技学院	172	1985	24.0	37.0
2	顾玉萍		20	80	6.0	7.0
3	张跟喜	扬州大学动物科技学院	55	269	9.0	14.0
4	樊庆灿	扬州大学动物科技学院	3	25	3.0	3.0
5	王永娟		3	21	2.0	3.0
6	张涛	扬州大学动物科技学院	22	75	4.0	8.0
7	王文浩	扬州大学动物科技学院	4	14	2.0	3.0