芒果炭疽病菌环境pH信号调控基因PalF的克隆与分析

• 作者: 张贺 漆艳香 蒲金基 谢艺贤 贾静
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 芒果 胶孢炭疽菌 pH信号转导途径
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 作物病虫害及防治
• 页码范围: 753-757
• 页数: 5页
• 分类号: Q78
• 字数: 3766字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.04.023

摘要

通过本地查找胶孢炭疽病菌(Colletotrichum gloeosporioides)橡胶菌株全基因组测序数据,获得PalF基因的序列信息.利用同源克隆的方法扩增胶孢炭疽病菌芒果菌株PalF基因,获得片段大小为2 369 bp的目的基因片段.对该基因序列进行分析发现,该片段含有完整的开放式阅读框,与橡胶炭疽菌PalF基因的序列同源性达100％.用RT-PCR的方法获得PalF基因的cDNA序列,序列进行分析发现该基因全长为2 310 bp,其中含有1个大小为59 bp的内含子,推测编码769个氨基酸.对PalF基因的氨基酸序列进行推测保守结构域分析可知PalF蛋白中含有Arrestin-C保守结构域,推测该基因参与环境pH感应信号转导途径(Ambient pH-sensing signal transduetion pathway)的调控,为进一步研究该基因在环境pH感应信号转导途径中的作用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张贺	中国热带农业科学院环境与植物保护研究所	51	215	8.0	12.0
2	蒲金基	中国热带农业科学院环境与植物保护研究所	91	827	16.0	25.0
3	漆艳香	中国热带农业科学院环境与植物保护研究所	60	511	14.0	21.0
4	谢艺贤	中国热带农业科学院环境与植物保护研究所	76	797	16.0	25.0
5	贾静	中国热带农业科学院环境与植物保护研究所	3	19	3.0	3.0