广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析

• 作者: 严振 刘永亮 欧阳蒲月 王瑛
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 医学
• 关键词: 广藿香 α-淀粉酶 PcAMY1基因 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 746-752
• 页数: 7页
• 分类号: R282.12
• 字数: 4329字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.04.022

摘要

为了解广藿香对淀粉的利用,克隆了广藿香(Pogostemon cablin)的α-淀粉酶(alpha-amylase,AMY)基因,对其进行相关生物信息学分析.搜索本课题组建立的广藿香转录组数据库,获得AMY基因全长序列,并设计全长引物进行PCR验证;利用生物信息学软件对AMY基因进行生物信息学分析.本研究获得的广藿香AMY基因命名为PcAMY1基因(GenBank登录号为KC862311),该基因全长1 420 bp,编码422个氨基酸.基于生物信息软件分析了PcAMY1基因编码蛋白的理化特性.系统进化树分析结果表明,PcAMY1基因与牵牛(Ipomoea nil)的AMY序列同源性最高,与赤豆(Vigna angularis)、菜豆(haseolus vulgaris)、蒺藜苜蓿(Medicago trunc atula)等植物次之,与自然进化关系保持一致.PcAMY1基因在广藿香嫩茎、成熟茎、老茎、嫩叶、成熟叶、老叶中均有表达,但在老茎中表达量最高.成功克隆到广藿香PcA MY1基因,并对其进行相关生物信息学与基因表达分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	严振		19	73	5.0	8.0
2	欧阳蒲月		37	255	9.0	14.0