胡萝卜DcDREB-A6亚族转录因子基因的克隆与非生物胁迫响应分析

• 作者: 徐志胜 李梦瑶 熊爱生 王枫 黄蔚
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 胡萝卜 转录因子 干旱响应元件结合蛋白(DREB) 荧光定量PCR 逆境调控
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1213-1222
• 页数: 10页
• 字数: 5415字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2014.10.004

摘要

干旱响应元件结合蛋白(dehydration responsive element-binding protein,DREB)类转录因子是干旱应答元件的结合蛋白,在植物响应非生物胁迫时发挥重要作用.本研究基于胡萝卜(Daucus carota L.)转录组数据,检索和拼接获得一个胡萝卜DREB类转录因子基因序列,并根据其序列设计引物,采用RT-PCR方法从黑田五寸获得该胡萝卜转录因子基因DcREB-A6(GenBank登录号:KM386646).序列分析显示,来源于胡萝卜中的DcDREB-A6基因含有993 bp的开放阅读框,编码330个氨基酸.氨基酸组成成分、理化性质、亲水性/疏水性和三级结构分析结果显示,胡萝卜DcDREB-A6转录因子蛋白质分子量为36.68kD,等电点为6.00,属于亲水性蛋白.进化树分析显示,DcDREB-A6属于APETLA2/乙烯反应元件结合蛋白(AP2/ERF)家族转录因子中DREB亚族中的A6组.空间结构表明,该转录因子结构域具有典型的植物AP2/ERF家族转录因子的结构特征,有1个α螺旋和3个β折叠.实时定量荧光PCR证实,胡萝卜DcDREB-A6转录因子基因受高温、低温和高盐胁迫诱导,分别在高温、低温处理4和2h后表达量增加2倍左右;盐胁迫对其影响较大,处理8h时,基因表达量增加4.6倍;而干旱胁迫下该基因表达变化幅度相对较小.胡萝卜DcDREB-A6转录因子基因能够响应高温、低温、干旱和高盐等非生物胁迫,本研究结果有助于进一步开展胡萝卜DREB类转录因子的逆境调控研究.