利用谱图校正提高色谱-质谱联用的分析效率

• 作者: 刘晓慧 张扬 杨芃原 殷薛飞 沈诚频 陆文渊
• 来源期刊: 色谱
• 学科: 化学
• 关键词: 高效液相色谱-串级质谱 谱图校正 蛋白质分析
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 349-354
• 页数: 6页
• 分类号: O658
• 字数: 5490字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1123.2013.10030

摘要

在使用对二甲基亚砜（ DMSO）和 NEDD8激活酶抑制剂（ MLN4924，MLN）刺激的人脐静脉内皮细胞（ HU-VEC）内的蛋白质进行分析的过程中，利用 Progenesis LC-MS 软件对色谱图进行了保留时间的校正，并比较了同组分多次重复实验中的谱图相似率及两种刺激下细胞内蛋白质色谱图的相似度。样品经双酶切处理后，加入 Qcon-CAT 标准蛋白质混合物作为参照，经高效液相色谱-串级质谱分离，后续又对谱图进行了校正与分析。经过谱图校正，将蛋白质鉴定结果从7000个左右提高到8000个以上，提高了蛋白质的鉴定效率。在利用谱图计数进行相对定量时，还分析了 DMSO 和 MLN 分别刺激 HUVEC 后细胞内的蛋白质差异在1000个左右，并给出了校正后的色谱总离子流图的相似度比较。相比其他方法更为简单快捷和流程化，具有高通量高灵敏度的优点。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨芃原	复旦大学化学系	114	952	18.0	27.0
2	张扬	复旦大学上海医学院生物医学研究院	13	104	5.0	10.0
3	刘晓慧	复旦大学上海医学院生物医学研究院	6	26	3.0	5.0
4	殷薛飞	复旦大学上海医学院生物医学研究院	3	4	1.0	2.0
5	沈诚频	复旦大学上海医学院生物医学研究院	2	1	1.0	1.0
6	陆文渊	复旦大学化学系	1	1	1.0	1.0