柴油食烷菌B-5及其卤代烷烃脱卤酶DadA对卤代化合物的降解

• 作者: 李安章 邵宗泽
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物降解 石油降解菌 柴油食烷菌B-5 卤代化合物 卤代烷烃脱卤酶
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 生态与环境微生物
• 页码范围: 1063-1072
• 分类号: Q935
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.2014.09.011

摘要

[目的]柴油食烷菌(Alcanivorax dieselolei)B-5是重要的石油降解菌.为研究其对卤代化合物的降解范围和降解机制,[方法]以不同的卤代化合物作为唯一碳源,观察菌株B-5在其中的生长情况;通过多重序列比对、系统发育分析和三维结构同源建模,分析该菌株基因组内一个假定的卤代烷烃脱卤酶(Haloalkane dehalogenase,HLD) DadA;利用大肠杆菌异源表达、纯化DadA,并测定了其对46个卤代底物的酶活.[结果]菌株B-5能够利用C3-C18链长范围的多种卤代化合物为唯一碳源生长;在系统进化树中,DadA相对独立于其他HLD-Ⅱ亚家族成员,但具有典型的HLD-Ⅱ亚家族的催化五联体残基;DadA确实具有脱卤活性,但该酶特异性高,底物范围明显小于其他已鉴定的HLDs,仅对1,2,3-三溴丙烷、1,2-二溴-3-氯丙烷和2,3-二氯-1-丙烯有脱卤酶活.[结论]因为DadA对很多B-5菌株可以利用做碳源的卤代底物没有脱卤酶活,所以推测B-5菌中可能还有其他脱卤酶参与了卤代烷烃的降解.菌株B-5及其卤代烷烃脱卤酶DadA在卤代烷烃污染物的生物降解方面具有应用潜力.