致胰腺泛黄鸭1型甲肝病毒全基因组分子特征

• 作者: 万春和 傅光华 傅秋玲 施少华 林建生 林芳 程龙飞 陈红梅 黄瑜
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 医学
• 关键词: 鸭1型甲肝病毒 胰腺炎 分子特征
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 侵染与免疫
• 页码范围: 1082-1089
• 分类号: R37
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.2014.09.013

摘要

[目的]揭示致胰腺泛黄鸭1型甲肝病毒(duck hepatitis A virus 1,DHAV-1)全基因组的分子特征.[方法]运用RT-PCR技术,扩增出致胰腺泛黄DHAV-1 MPZJ1206株全基因组序列,并与鸭甲肝病毒参考毒株基因组序列进行比对分析.[结果]致胰腺泛黄DHAV-1 MPZJ1206株基因组全长为7703 nt,(G+C)％为43.05％,包含一个大的开放阅读框,编码2249个氨基酸残基的多聚蛋白,基因组结构与其他DHAV-1参考毒株一致.序列比对结果显示,MPZJ1206株全基因组序列与GenBank数据库中DHAV-1参考毒株核苷酸序列同源性在93.5％-99.6％之间,氨基酸同源性在97.9％-99.6％之间,遗传距离均低于7％;分子系统进化分析显示与2011年分离的2株DHAV-1(Du/CH/LGD/111238和Du/CH/LGD/111239)亲缘关系最近.[结论]尽管MPZJ1206毒株感染雏番鸭引起的临床病变与传统DHAV-1差异明显,但其基因组分子特征与传统的DHAV-1毒株相似,病毒致病型的改变可能与其组织嗜性改变相关.