大豆gma-miR1508a靶基因预测及功能分析

• 作者: 李文滨 李永光 王涛 艾佳 邱丽娟 金龙国
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 miRNA 启动子 靶基因
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 479-482
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2014.04.0479

摘要

microRNA(miRNA)是生物中广泛分布的、内源性的、由21～25个核苷酸大小的非编码单链小分子RNA.miRNA与靶基因mRNA具有互补关系,能够介导降解靶基因和转录后水平的基因沉默,引起目的基因表达的下调.通过利用PlantCARE、PMRD、BAR等数据库对gma-miR1508a启动子顺式调控元件和靶基因进行了生物信息学分析,启动子分析结果表明gma-miR1508a含有多种非生物胁迫响应元件,其表达受ABA、低温、干旱等胁迫诱导.利用PMRD软件预测获得7个gma-miR1508a的靶基因,分别参与了细胞凋亡、开花调控、逆境胁迫、细胞壁修饰等调控,最终通过拟南芥同源基因分析获得了Glyma10g03840.1、Glyma16g27800.1、Glyma17g07280.1等5个与低温反应相关的候选靶基因.