大豆DNA去甲基化酶IDM1基因5'调控区生物信息学分析

• 作者: 张文慧 方淑梅 李丹丹 梁喜龙 洪艳华 范金辉 韩毅强
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 DNA去甲基化酶 IDM1 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 483-487
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2014.04.0483

摘要

利用生物信息学方法分析了IDM1基因在大豆中的存在状况及其5'调控区的启动子序列、甲基化位点及转录因子结合位点的分布情况.结果表明:IDM1基因在大豆中存在2个拷贝Glyma12g35760和Glyma 13 g34641,并且在表达时存在选择性剪接.对5'端的-2 000 ～200 bp序列分析发现,Glyma12g35760存在1段可能的启动子序列,1个CpG岛,大小为133 bp,位于495 ～627核酸序列之间,存在5个可能的转录因子结合位点,转录因子有SBF-1和athb-1两种;Glyma13g34641存在8段可能的启动子序列,无CpG岛,存在6个可能的转录因子结合位点,转录因子有P,SBF-1,MYB.Ph.该分析结果可为IDM1基因在大豆中的试验研究提供有价值的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁喜龙	黑龙江八一农垦大学农学院	60	389	10.0	18.0
2	韩毅强	黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院	59	269	8.0	12.0
3	张文慧	黑龙江八一农垦大学农学院	22	65	5.0	6.0
4	方淑梅	黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院	37	145	7.0	10.0
5	李丹丹	黑龙江八一农垦大学农学院	44	171	7.0	10.0
6	洪艳华	黑龙江八一农垦大学农学院	17	33	3.0	5.0
7	范金辉	黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院	1	0	0.0	0.0