凡纳滨对虾AP-1基因的克隆和表达特征分析

• 作者: 刘逸尘 吴冰 孙金生 张亦陈 耿绪云
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 凡纳滨对虾 转录因子激活蛋白(AP-1) 序列分析 表达谱分析 免疫应答
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 页码范围: 1294-1301
• 分类号: Q785|S966.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2014.49134

摘要

为了探讨凡纳滨对虾转录因子AP-1在病毒引发的免疫应答过程中的潜在作用,实验根据前期的转录组和表达谱结果提示信息,首次克隆了凡纳滨对虾AP-1基因(LvAP-1,GenBank 注册号:KF999956),利用在线软件进行了生物信息学分析,运用半定量的方法进行了组织表达分析,并利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术分析了该基因在白斑杆状病毒(WSSV)侵染过程中的表达变化特征.结果显示,AP-1基因ORF区全长882 bp,编码293个氨基酸.预测分析显示该基因编码的蛋白质含有1个Jun结构域和1个高度保守的亮氨酸拉链结构域(bZIP),其中Jun结构域在非脊椎动物中保守性不高.组织表达分析表明,该基因在凡纳滨对虾各组织中广泛表达,其中在血细胞中表达量最高.在WSSV感染早期(0.5 hpi),该基因表达没有显著改变,感染后5 h(5 hpi),AP-1基因开始显著上调表达,在人工感染后24 h,该基因的表达量达到最高(P＜0.01).研究表明,该基因在一定程度上参与了凡纳滨对虾体内由WSSV引发的先天免疫应答过程,为进一步研究LvAP-1在对虾应答病毒侵染过程中的功能和作用机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	耿绪云		41	261	7.0	15.0
2	孙金生	天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室	49	320	8.0	17.0
6	张亦陈	天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室	15	49	4.0	6.0
7	刘逸尘	天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室	15	50	4.0	6.0
8	吴冰	天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室	1	4	1.0	1.0