池蝶蚌致雄性化基因fem-1c及其蛋白分子的结构特征分析

• 作者: 史建伍 彭扣 洪一江 熊文芳 王军花 盛军庆 蒋谋炎 陈永玲
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 池蝶蚌 fem-1c基因 克隆 序列分析 结构预测
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 页码范围: 1002-1007
• 页数: 6页
• 分类号: Q781
• 字数: 4504字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2014.148

摘要

研究首次获得淡水珍珠贝池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)的致雄性化基因feminization-1C亚型,即fem-1c基因,并进行全长克隆及序列分析。从转录组中Race-PCR扩增fem-1c基因全长cDNA序列,用生物信息学方法对 fem-1c 基因进行基因组结构分析、多序列同源性比较、跨膜区段、亲疏水性分析、功能结构域预测等。研究结果如下：该cDNA序列全长2328 bp,包含一个1869 bp的最大开放阅读框,编码622个氨基酸,经同源比对和进化树分析, fem-1基因c亚型编码的氨基酸与太平洋牡蛎的同源性最高,为79%；疏水性分析显示该蛋白为亲水性蛋白；二级结构预测发现该蛋白有大量的α螺旋和随机卷曲,形成9个锚蛋白重复序列(Ankyrin repeat, ANK),同时,三级结构预测中可以清楚的看到9个ANK模体,跟SMART预测的结构位点结果相近。从无脊椎动物到脊椎动物 fem-1c 基因的保守性表明它们有共同的起源,暗示这个基因家族在功能上具备保守性,推测池蝶蚌fem-1c基因可能具备与线虫fem-1基因在性别决定方面上相似的功能。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王军花	南昌大学生命科学与食品工程学院	50	354	9.0	16.0
2	盛军庆	南昌大学生命科学与食品工程学院	30	173	7.0	11.0
3	彭扣	南昌大学生命科学与食品工程学院	15	37	4.0	5.0
4	史建伍	南昌大学生命科学与食品工程学院	8	17	3.0	3.0
5	陈永玲	南昌大学生命科学与食品工程学院	2	2	1.0	1.0
6	熊文芳	南昌大学生命科学与食品工程学院	2	2	1.0	1.0
7	蒋谋炎	南昌大学生命科学与食品工程学院	1	2	1.0	1.0