西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性及系统进化分析

• 作者: 信金伟 姬秋梅 张成福 曾贤彬 柴志欣 海汀 钟金城
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 西藏牦牛 mtDNA ND6基因 遗传多样性 系统进化
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 11-17
• 页数: 7页
• 分类号: S811.6
• 字数: 4323字
• 语种: 中文

摘要

为从分子水平上探究西藏牦牛的序列多态性、遗传多态性及其系统进化关系,对西藏15个牦牛类群150个个体的mtDNA ND6基因全序列进行了测定,确定了多态位点和单倍型数目,计算了单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi),并构建了分子聚类关系图和单倍型系统发育树.结果表明:西藏牦牛mtDNA ND6基因全序列长度均为528 bp,T、C、A和G4种碱基的平均比例分别为42.2％、7.6％、20.9％、29.3％,存在一定的碱基组成偏倚性.序列变异中存在转换、颠换2种核苷酸变异类型,其中转换37次,颠换2次,表现出较强的转换偏倚性.根据序列间核苷酸变异共确定7种单倍型,其中Hap_1为西藏牦牛类群的主流单倍型,其余6种单倍型为部分类群所特有.平均单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.2978、0.00191,揭示西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性较贫乏.根据遗传距离构建了分子聚类关系图,表明西藏15个牦牛类群可分为2大类;根据7种单倍型序列构建了单倍型系统发育树,表明西藏牦牛存在2个母系起源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姬秋梅	西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所	39	415	13.0	18.0
2	张成福	西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所	23	162	7.0	12.0
3	信金伟	西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所	21	145	7.0	11.0