利用基因组比对方法寻找大肠杆菌DH1基因组中的非必需序列

• 作者: 周长林 方宏清 童贻刚 虞剑 黄勇
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因组比对 非必需序列 大肠杆菌DH1
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 640-643
• 页数: 4页
• 分类号: Q811.4|Q78
• 字数: 3128字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2014.05.009

摘要

目的:寻找大肠杆菌DH1基因组中的非必需序列.方法:采用基因组比对的方法,通过软件MAUVE分别对大肠杆菌DH1与miniMG1655、miniW3110进行基因组比对,筛选得到大肠杆菌DH1基因组中的候选非必需序列,进而以基因必需性评分的方法确定非必需序列.结果与结论:通过基因组比对及基因必需性评分的方法,确定了大肠杆菌DH1基因组中64个非必需序列区域,占全基因组的26.3％.非必需序列区域的确定,为后续构建基因组减小的大肠杆菌miniDH1提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方宏清	军事医学科学院生物工程研究所	42	245	8.0	13.0
2	周长林	中国药科大学生命科学与技术学院	80	451	12.0	18.0
3	童贻刚	军事医学科学院微生物流行病研究所	58	363	11.0	17.0
4	虞剑	中国药科大学生命科学与技术学院	7	6	2.0	2.0
6	黄勇	军事医学科学院微生物流行病研究所	5	20	3.0	4.0