巴西橡胶树HbUBC5基因克隆、生物信息学及表达分析

• 作者: 刘向红 刘辉 李德军 邓治
• 来源期刊: 天津农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 巴西橡胶树 泛素接合酶 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 植物生理与生物技术
• 页码范围: 6-10
• 页数: 5页
• 分类号: S794.1
• 字数: 3173字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-6500.2014.07.002

摘要

为研究巴西橡胶树泛素结合酶(UBC)基因功能,采用PCR技术从巴西橡胶树中克隆了一个UBC基因,用半定量RT-PCR分析基因表达模式,同时对基因编码蛋白进行生物信息学分析.结果表明,基因长681 bp,最长开放阅读框555 bp,预测编码蛋白包含184个氨基酸;序列比对分析发现,该基因编码的蛋白具有一段保守的UBC结构域,与拟南芥E2成员UBC5(At1g63800)具有较高的相似性,故将该基因命名为HbUBC5.半定量RT-PCR分析结果表明,HbUBC5在巴西橡胶树胶乳中表达最高,在树皮中表达最低.HbUBC5在叶片不同发育时期表达模式存在变化,在古铜期最低,在稳定期最高.与健康橡胶树相比,死皮树胶乳中Hb UBC5表达量明显下降.Hb UBC5表达还受乙烯和茉莉酸调控.以上结果表明,HbUBC5可能在巴西橡胶树死皮、产排胶、乙烯和茉莉酸反应中发挥作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓治	中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室	21	69	5.0	7.0
2	刘向红	中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室	6	9	2.0	2.0
6	李德军	中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室	20	42	3.0	6.0
7	刘辉	中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室	7	13	2.0	3.0