若尔盖高原湿地土壤氨氧化古菌的多样性

• 作者: 张小平 王宪斌 辜运富 郑有坤
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 若尔盖湿地 氨氧化古菌 amoA基因 多样性
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1090-1096
• 分类号: Q939
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.2014.09.014

摘要

[目的]研究自然界中氨氧化古菌(ammonia-oxidizing archaea,AOA)对于理解全球氮循环起着至关重要的作用,但人们对高原湿地AOA种群生态还知之甚少.本研究旨在了解若尔盖高原湿地土壤AOA群落组成及多样性.[方法]从若尔盖高原阿西(A'xi)、麦西(Maixi)和分区(Fenqu)3个典型牧区采集土壤样品,提取土壤总DNA,利用AOA氨单加氧酶(ammonia monooxygenase,amoA)基因通用引物扩增amoA基因,构建amoA基因克隆文库.从每个克隆文库中随机挑选80个阳性克隆子用于后续限制性酶切片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)分析,挑选不同酶切类型的克隆子进行测序、比对,利用MEGA 5.0软件构建amoA基因系统发育树.[结果]从3个克隆文库共240个AOA amoA基因阳性克隆中得到15条代表序列,通过Mothur软件进行OTUs (operational taxonomic units)分类得到7个不同的分类单元.其中OTU 6为优势类群,在3个克隆文库均有发现,约占所有特异性克隆子的27％.15条amoA基因序列分属于Zoige Wetland Clade 1(4OTUs)、Zoige Wetland Clade 2(2OTUs)和Zoige Wetland Clade 3(1OTU)3个系统发育分支.BLAST分析显示所有OTUs均归于泉古菌门(Crenarchaeota).相关性分析表明,若尔盖高原湿地AOA多样性指数与土壤铵态氮和硝态氮含量存在显著的相关性(P＜0.05).[结论]若尔盖高原湿地中AOA多样性较低,均属于泉古菌,且与土壤中氨态氮和硝态氮密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张小平	四川农业大学资源环境学院	137	2144	25.0	38.0
2	辜运富	四川农业大学资源环境学院	38	430	10.0	19.0
3	郑有坤	四川农业大学资源环境学院	5	59	4.0	5.0
7	王宪斌	四川农业大学资源环境学院	1	15	1.0	1.0