普通菜豆基因组SSR标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析

• 作者: 张晓艳 杨广东 武晶 王兰芬 王述民 陈明丽
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 普通菜豆 豇豆属 SSR标记 通用性
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 924-933
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2014.00924

摘要

分子标记具种属间通用性可提高其利用效率,并降低标记开发成本.本研究基于Roche 454超高通量测序技术获得普通菜豆基因组测序结果,共开发了560个普通菜豆基因组SSR标记.利用2份普通菜豆品种对标记进行初步筛选,有421个标记能够有效扩增.用新开发的标记分析16份豇豆和16份小豆的通用性.结果显示,185个普通菜豆基因组SSR标记在豇豆中能有效扩增,通用性比率为43.9％; 161个SSR标记在小豆中能有效扩增,通用性比率为38.2％;在豇豆和小豆中都能获得有效扩增条带的标记共138个;并且普通菜豆基因序列SSR标记在豇豆和小豆中的通用性比率高于基因间序列SSR标记.通用性标记的多态性分析表明,豇豆和小豆的多态性比率分别为34.0％和24.8％;且豇豆和小豆中基因间标记的多态性都比基因内标记的多态性高.上述通用性标记为豇豆属作物的多样性评价、连锁图谱的构建及基因定位等方面的研究提供了便利.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈明丽	中国农业科学院作物科学研究所	7	26	3.0	5.0
2	王兰芬	中国农业科学院作物科学研究所	14	422	5.0	14.0
3	王述民	中国农业科学院作物科学研究所	33	653	13.0	25.0
4	武晶	中国农业科学院作物科学研究所	10	32	4.0	5.0
5	张晓艳	青岛市农业科学研究院蔬菜所	8	60	3.0	7.0